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E1顯微鏡下的大明之絲絹案 第1集
帥家默、丰寶玉在賭場與鹿飛龍起爭執，引發騷亂。仁華縣衙內，知縣方懋珍為迎接即將上任的知府決議三案同審提高效率，因都涉及鹿飛龍，狀師程仁清出面擺平。帥家默發現見過的所有地契與實際田畝數不符，心生疑慮。
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E2顯微鏡下的大明之絲絹案 第2集
帥家默發現仁華縣稅賦疏漏，每年需多交三千五百三十兩。因此向縣衙提告，遭各房推諉，同時因擅闖架閣庫挨板子。新任知府黃凝道履任，下屬各縣知縣百般藉口，不予拜見。豐氏姐弟看望帥家默，決定幫助提告。
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E3顯微鏡下的大明之絲絹案 第3集
帥家默調查“人丁絲絹稅”，引起鄉紳範淵注意。帥家默、丰寶玉在向知府黃凝道匯報調查之時，其餘三縣知縣和主簿“碰巧”前來拜見新知府，藉機一同聽取匯報。衙門裡，“人丁絲絹稅“匯報引發各縣不滿。
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E4顯微鏡下的大明之絲絹案 第4集
黃知府與各知縣繼續商討，逼迫帥家默講出掀起“人丁絲絹稅”的真實用意，進而叫來程仁清道出帥家默父親貪污而後遭受火災一事。程仁清將帥家默提告歸結為挾私報復，帥家默被羈押牢房。
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E5顯微鏡下的大明之絲絹案 第5集
帥家默、丰寶玉決定去省城提告。範淵知道動向後大怒，程仁清啟程攔截。帥家默殘存的記憶中閃現出父親所著之書，但回憶無果。帥家默、丰寶玉在省城花錢求人，最終仍提告無果。
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E6顯微鏡下的大明之絲絹案 第6集
帥豐二人找到劉巡按提告，因黃知府所留條陳引起巡案注意， 決定前往金安府調查。第一站，眾人前往攬溪縣，雖然毛知縣再三推諉，但最終同意帥家默進入攬溪縣架閣庫調查。
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E7顯微鏡下的大明之絲絹案 第7集
劉巡按調查架閣庫失火，程仁清藉機陷害帥豐二人，編造逃逸假象。帥豐二人被綁後，藉機逃跑中丰寶玉受傷，再次遇見陳小枝父女獲救。帥家默終於想出父親所著之書名稱是《絲絹全書》，確定“人丁絲絹稅”與父母也有關聯。
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E8顯微鏡下的大明之絲絹案 第8集
程仁清預留帥豐二人性命，私下找到豐碧玉提救人之法，豐碧玉向方懋珍求情。帥豐二人被交接至攬溪縣境內，半路遇任主薄，帥家默開始了解父親過往。鹿飛龍被安排交接帥豐二人預半路截殺。
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E9顯微鏡下的大明之絲絹案 第9集
範淵請各知縣與鄉紳赴宴，要求共同應對三司聯審。聯審開始，攬溪縣架閣庫老吏假口供被揭穿，帥豐二人被釋放。因資料被燒，帥家默無從反饋“人丁絲絹稅”具體信息，但可調查仁華、攬溪二縣賦役白冊，同樣可以查清“人丁絲絹稅“由來。此議再次遭到各縣反對。
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E10顯微鏡下的大明之絲絹案 第10集
豐碧玉勸丰寶玉不再摻和絲絹稅之事，卻提醒了丰寶玉。午休之時，馬文才挑釁程仁清，道出程仁清過往，讓其備受羞辱。三司聯審繼續，帥家默當庭計算稅賦，指出需重新統計田畝。出乎眾人預料，馬文才支持，八縣重新丈量田畝。
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E11顯微鏡下的大明之絲絹案 第11集
重新量田的胥吏，是由范淵為首的鄉紳集團安排。他們故意擴大田畝數，引得民怨載道，黃知府劉巡按卻被蒙蔽，範淵教唆鹿飛龍在民間散佈流言蜚語。丰寶玉向程仁清求助，程仁清告知丰寶玉帥家默將遇大劫。
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E12顯微鏡下的大明之絲絹案 第12集
兵備道押送帥家默，被方懋珍阻攔帶入仁華縣衙。馬文才親自提人，再遭方懋珍阻攔，爭取出五日期限。程仁清丰寶玉請求任主薄相助，獲得《絲絹全書》，二人了解真實土地過往。於是兵分兩路，求援與救人。
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E13顯微鏡下的大明之絲絹案 第13集
李世達曾與範淵共同調查帥家默父親帥敦誠貪墨之事，知曉部分“人丁絲絹稅“過往。開庭審理之時，他拿出《絲絹全書》展示真實土地交易與記錄，提出鄉紳隱田問題。
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E14顯微鏡下的大明之絲絹案 第14集
程仁清因有辱堂威，被杖責要求離開公堂。丰寶玉再提清丈，在堂上據理力爭，旁聽百姓為丰寶玉作證。攬溪縣架閣庫老吏出庭作證，揭發作偽證事實，堂上一通混亂，範淵藉機燒毀《絲絹全書》。與此同時，馬文才、鹿飛龍動手刺殺豐碧玉、程仁清。
